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找到 作者 包含"曾宪涛" 78条结果
  • R软件R2WinBUGS程序包在网状Meta分析中的应用

    R软件是一个自由、免费及开放的统计软件,并具有强大的绘图功能,但其处理网状Meta分析数据的代码命令较为复杂,因此易错且不易掌握。WinBUGS软件是基于贝叶斯理论而开发的一款统计软件,具有强大的数据处理功能,在处理网状Meta分析数据时,代码编写易懂且操作方便,但对结果的绘图功能欠佳。为充分发挥R软件与WinBUGS软件各自的优势,开发者在R软件的基础上研发了R2WinBUGS程序包,构建了R软件与WinBUGS软件之间的“桥梁”,使网状Meta分析的过程和结果处理方便快捷又美观。本文以实例操作的方式展示使用R软件R2WinBUGS程序包进行网状Meta分析的过程。

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  • R软件gemtc程序包在网状Meta分析中的应用

    R软件相关程序包对于网状Meta分析的理论原理大多是基于贝叶斯统计模型,也有少部分使用广义线性模型。R软件gemtc程序包通过调用对应的rjags程序包、BRugs程序包或R2WinBUGS程序包(软件依次为JAGS、OpenBUGS及WinBUGS)来执行网状Meta分析。同时,还可以为GeMTC软件生成相关的数据存储文件。其本质是调用基于MCMC法的软件进行网状Meta分析。本文简要介绍R软件gemtc程序包调用OpenBUGS软件进行网状Meta分析。

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  • 网状Meta分析中网状关系图的绘制

    网状关系图能够清晰地展示网状Meta分析时各干预措施间存在的直接比较关系。目前有较多绘制网状关系图的方法,但不同方法绘制的网状关系图所提供的信息量有所区别,且软件不同,其操作的友好程度亦不一样。本文简要介绍了如何应用R软件network程序包和gemtc程序包、Stata软件、ADDIS软件绘制网状关系图,并对其异同点进行了比较。

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  • 网状Meta分析在Stata软件中的实现

    WinBUGS软件除了能够与R软件配合实现网状Meta分析外,还可以通过与Stata软件配合实现。与R软件不同的是,通过Stata软件实现时需先行创建相关的ADO脚本文件,从而极大地简化了操作过程。与R软件相同的是,在绘制网状关系图时,Stata软件亦需要另行加载一个程序包。本文简要介绍了如何使用Stata软件调用Win BUGS软件实现网状Meta分析。

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  • 应用ADDIS软件实现网状Meta分析

    在当前能够实现网状Meta分析的软件中,ADDIS软件是一款基于贝叶斯框架、运用Markov chain Monte Carlo(MCMC)法对数据进行先验评估与处理的非编程软件。该软件操作较为简便,只需操作者对模型一致性及结果收敛性诊断做相关判断后,软件将自动产出结果及相关图形;但该软件的最大缺点在于数据录入较为繁琐。本文介绍了如何应用ADDIS软件实现网状Meta分析。

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  • R软件Metafor程序包在Meta分析中的应用

    R软件是一款免费使用且功能强大的统计软件,常用的Meta分析程序包有Metafor、Meta、Rmeta等。Metafor程序包可以方便地进行Meta分析,包括二分类及连续性变量的Meta分析、Meta回归、累积Meta分析及对发表偏倚的Begg’s检验和Egger’s检验等,以及绘制森林图、漏斗图、星状图、拉贝图、Q-Q 正态分位图等图形。此外,Metafor程序包是R软件Meta分析程序包中唯一可以进行混合效应模型(包括单个、多个分类或连续性变量)拟合运算的,还可以检验模型系数并获得可信区间。本文结合实例对应用Metafor程序包进行Meta分析的具体操作方法进行详细介绍。

    发表时间:2016-09-07 11:00 导出 下载 收藏 扫码
  • R软件nlme程序包在网状Meta分析中的应用

    nlme程序包是基于广义最小二乘法和线性混合效应模型研发的、可通过R软件实现广义线性和非线性混合效应模型下的Meta分析。该程序包实现Meta分析时,需要对数据先行转化为效应量的对数值才可进行。本文介绍了使用R软件nlme程序包实现网状Meta分析的过程,详细呈现了如何转化数据这一核心步骤。

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  • R软件调用JAGS软件实现网状Meta分析

    JAGS(Just Another Gibbs Sampler)是为弥补BUGS软件无法在Unix或Linux等非Windows系统上运行的缺陷而研发的编程软件,其自身独立拥有一套贝叶斯理论运算函数及公式,具有操作界面简单、与系统兼容好、运行流畅、且与其他编程软件具有良好交互性等特点。然而,由于JAGS软件在结果数据读取、解读以及图形绘制方面存在功能性缺失,限制了其推广应用;通过R2jags、rjags及runjags程序包从R中调用JAGS软件则克服了这些缺陷。R2jags、rjags及runjags这3款程序包的工作原理均是在R语言的框架下通过调用JAGS软件来完成相关迭代运算,它们的功能结构基本相似,都具有操作简单、命令简洁、数据读取和结果汇总以及图形绘制功能较完善的特点,但在实践运用中仍存在差异。本文介绍了如何使用R软件通过R2jags、rjags及runjags程序包调用JAGS软件来实现网状Meta分析。

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  • R软件调用OpenBUGS软件实现网状Meta分析

    R软件当前可通过R2OpenBUGS程序包、BRugs程序包和rbugs程序包来调用OpenBUGS程序包实现网状Meta分析。本文分别对这3种程序包实现网状Meta分析的过程进行演示。从结果来看,3种程序包的计算结果相近,但rbugs程序包无绘图功能,仅R2OpenBUGS程序包能绘制森林图。

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  • 应用R语言netmeta程序包实现网状Meta分析

    netmeta程序包是基于经典频率学派研发、在R语言框架下运行的专用于网状Meta分析的程序包。该程序包克服了基于贝叶斯统计学派研发的软件及程序包实现网状Meta分析时对先验设定的难点,同时具备操作流程简单、操作难度小等优点。此外,该程序包还能同时以随机效应与固定效应模型展现单个配对研究及Meta分析合并的结果,并能绘制森林图。本文通过实例展示了应用netmeta程序包实现网状Meta分析的过程。

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